鱉的敵害主要有老鼠、蛇類、鳥類、螞蟻、蚊子等，主要危害鱉卵及1齡以下的稚、幼鱉，1齡以上體質健壯的鱉危害甚少。其中老鼠對鱉卵危害最大。

夜深人靜是鱉產卵之良辰，老鼠也會趁此出洞，頻繁活動于產卵場所，一方面干擾鱉正常產卵，另一方面老鼠在沙床上到處挖穴，引起鱉卵震動而導致胚胎死亡。

稚、幼鱉也容易被老鼠圍攻和捕食，一些體質差、反應較遲鈍的成鱉，在伏岸休息時，也常是老鼠襲擊的目標。老鼠食鱉時，首先咬住鱉的頸部，繼而將喉管咬斷，掏出內臟吸取鮮血，取食鱉肉，然后逃之夭夭。

一旦遭鼠害，如不及時采取措施，一個晚上少則咬死3～4只鱉，多則幾十只，尤其對稚、幼鱉危害更大。其次是蛇類，因其會挖掘泥沙，吞食鱉卵及剛孵化脫殼的稚鱉，危害甚大。

鸕鶿、翠鳥等鳥類，主要捕食稚鱉，有的鳥類還可攜帶病原體，從而傳播疾病。所以在養鱉過程中，要加強這些敵害的防治，其防治方法如下：

1、鱉卵孵化室壁和稚鱉池最好用水泥磚結構，不留洞穴，堵塞鼠、蛇過往通道和藏身之所；

2、孵化室周圍建造防蟻溝，溝深寬約10厘米，溝內注水，防止螞蟻進入室內；

3、產卵場、孵化場及稚鱉池周圍，經常用藥餌毒殺老鼠、蛇，或設置誘捕器捕捉；

4、經常用藥噴殺蚊子；

5、鳥類可張網防止，也可用彈弓等工具驅趕。