物理調控法 該法是采用沉淀池過濾或沸石粉吸咐，將養殖水體中的雜質和污染物去除。此法不會對養殖環境造成二次污染。

    

　　化學調控法 即采用生石灰、漂白粉、絮凝劑、含氯或含溴消毒劑以及一些染料等有機或無機化合物來改善水質。這種方法是治標不治本的方法，只能在短期內產生效應，且在改良水環境的同時，會對水產動物產生不良影響，有些甚至會對環境與食品安全產生重大影響，故要慎重使用。

    

　　生物調控法 采用水草的種植、螺螄的放養、有益菌的添加和浮游生物的培育（如施肥）等，利用有益微生物在水體吸收氨氮、亞硝酸氮及硫化氫等，能有效分解大分子有機物，同時抑制致病菌的大量繁殖。該法是目前比較流行的新型處理方法，也是推行綠色養殖的最佳措施。。可根據養殖品種選擇相應的生物調控法。

    

　　目前應用最廣泛的有益菌是光合細菌。應用光合細菌應注意：配合使用。該菌的活菌形態微細、比重小，若采用直接潑灑的方法，其活菌不易沉降到池塘底部，無法起到良好的改善底環境的效果。因此，建議全池潑灑光合細菌時，盡量將其與沸石粉合劑應用，這樣既能將活菌迅速沉降到底部，又能起到吸咐氨的效果。適溫使用。使用光合細菌的適宜水溫為15℃~40℃，較適水溫為28℃~36℃，因而宜掌握在水溫20℃以上時使用。陰雨天勿用。與肥混用。將光合細菌與有機肥或無機肥混合應用，可明顯增強使用效果。視水質使用。要根據水質實際狀況決定應用方法：水質較肥時，使用光合細菌可促進有機污染物的轉化，避免有害物質積累，改善水體環境和培育天然餌料，保證水體溶氧；水質清瘦時，使用光合細菌前應先施肥，以保持光合細菌在水體中的活力和繁殖優勢，降低使用成本；在酸性水體中使用光合細菌，應先施用生石灰，間隔3~4天再使用光合細菌；要避免與消毒殺菌劑混合使用。