4月以來是小麥進入營養和生殖生長并重時期，即穗分化期。進入此期后是小麥需肥、需水最多時期，也是白粉病、紋枯病、赤霉病和蚜蟲、麥蜘蛛、吸漿蟲等危害最重的時期，同時也是小麥根系活力開始下降，即黃根增多、白根減少、根系吸肥、吸水能力降低的時期。因此，在拔節孕穗肥的基礎上，還應在穗分化期到孕穗期，即4月上中旬，小麥齊穗期，即4月底到5月初，揚花后灌漿前期，即5月上中旬，共分3次搞好小麥中后期藥肥混噴。

藥肥混噴有如下好處：一是節約成本。將殺菌劑、殺蟲劑、調節劑(或葉面肥)“三劑”合一配在一起噴霧，減少用藥量的同時，還可減少噴藥次數，降低勞動力成本，據測算，每畝可節約用藥、用肥和勞動力噴霧等成本20元以上。二是提高防效。將殺菌劑、殺蟲劑、調節劑配在一起噴霧，可增加藥肥濃度，使“三劑”互相促進、互為補充，提高了藥肥的利用效率，防病、治蟲、增產效果比較明顯，可及早把小麥病蟲害、早衰等消滅在萌芽狀態。三是增產增效顯著。根據近幾年實踐和調查，凡是在小麥中后期進行3次藥肥混噴的小麥，秸稈變粗壯、柔韌性增強、葉色變肥厚、濃綠、穗大粒多、籽粒飽滿、稈青籽黃、病蟲害發生輕，一般增產15%以上，畝增效益120元以上。

根據調查，用于小麥3次藥肥混噴的殺菌劑主要有：井崗霉素、紋枯凈(井崗霉素和蠟質蚜孢桿菌復配)、三唑酮、乙蒜素、烯唑醇、腈菌唑、多菌靈、福美胂、福美雙等及其復配劑，第一次主要用前五種，以防治紋枯病、白粉病、銹病等為主，第二第三次用后七種，以防治白粉病、赤霉病為主。殺蟲劑主要有：氯氰菊酯、氯氟氰菊酯、溴氰菊酯、辛硫磷、毒死蜱、吡蟲啉、阿維菌素、甲維鹽等及其復配劑等無公害農藥，應嚴禁使用甲胺磷等高毒、高殘留農藥；調節劑(或葉面肥)主要有：第一次可用強力生根壯苗劑、生根粉、復硝酚鈉等，以促進和提高根系活力；第二次可用氨基酸、腐殖酸、黃腐酸、微量元素等，以補充營養和促進葉片光合作用；第三次可用磷酸二氫鉀、細胞激活劑、活性酶等調節劑，以促進物質運輸和增強整株小麥的活力，防止后期早衰等。另外，為補充氮素營養的不足，每次藥肥混噴都可加入150克左右的尿素。