一、辣椒枯萎病　
　　辣椒枯萎病為真菌性病害。發病初期辣椒葉片變黃，后期植株迅速凋萎，根部及莖基部皮層變褐色壞死腐爛，木質部暗竭色，高濕時對病部產生藍白色霉狀物，壞死部位從外向里發展，無菌濃。此病在雨多濕度大的條件下容易發生。　　
　　防治用藥：先清除病株，再用枯萎靈、可殺得、多菌靈等灌根2~3次，每株灌藥液500g。
　　二、辣椒青枯病
　　辣椒青枯病為細菌性病害。發病初期生長點附近葉片突然萎蔫，夜間恢復，后期全株青枯狀枯焦。病株莖根維管束變褐色腐爛，將病莖插入透明玻璃杯水中，可見乳白色粘液溢出，即病原細菌。青枯病屬土傳性病害，多從根部傷口浸染。　　
　　防治上應注意：1、實行水旱輪作。2、酸性土施石灰改良土壤。3、清除病株。藥物防治可用硫酸鏈霉素等灌根2~3次。　　
　　三、辣椒根腐病
　　辣椒根腐病屬真菌性病害。發病初期白天枝葉萎焉，傍晚至清晨恢復正常，后期全株枯萎，根部皮層褐色腐爛，極易剝離，木質部暗色。　　
　　防治用藥：根腐靈、多菌靈等灌根2~3次。　　
　　四、生理性枯萎　　
　　1.因積水引起根部呼吸困難窒息腐爛而枯萎。　　
　　2.施肥濃度過大或粒狀肥施近莖基部引起燒根莖而導致枯萎。　　
　　3.干旱失水引起枯萎。