有機磷農藥大多數具有酸性，在堿性條件下不穩定，容易分解生成無生物活性的物質，失去防治效果。如殺螟松、馬拉硫磷、樂果等殺蟲劑及稻瘟凈、異稻瘟凈等殺菌劑，都不能和堿性農藥復配混用。與此相反，八甲磷在堿性介質中穩定，在酸性介質中反而容易分解。

氨基甲酸酯類農藥和有機磷農藥一樣，遇堿容易分解失效，不宜和堿性農藥復配混用。

在有機硫類殺菌劑中，二硫代氨基甲酸衍生物如代森鋅、福美鋅、福美雙等，雖然有一定的穩定性，但在強堿性條件下易分解失效，不宜和堿性農藥復配混用。內吸性殺菌劑如多菌靈、硫菌靈、三環唑等，都有一定的穩定性，適合與許多保護性殺菌劑混用。

植物性農藥性質比較復雜，一般與有機合成的藥劑復配混用時不起多大的化學作用，對藥劑的效果影響不大。

在農藥復配混用中，最容易發生化學反應、降低藥效、出現藥害的是無機農藥。在無機農藥中，堿性農藥和含金屬元素的農藥最多，它們在復配混用中最容易使其它農藥分解失效，或產生藥害。因而，兩種或幾種農藥是否適于復配混用，必須通過試驗加以證實。