堆肥處理是固體廢棄物如畜禽糞便、城市鄉鎮生活垃圾、農作物秸稈、農副產品加工廢棄物，減量化、無害化以及資源化最有效的處理方法。江蘇省農科院資源與環境研究中心土肥專家馬艷通過研究發現，堆肥除了具有較好的肥效以外，還有“藥效”，能抑制多種土傳病原菌的生長、繁殖，對黃瓜猝倒病等土傳病害具有一定的防治效果。

馬艷介紹說，固體廢棄物堆肥過程中，經過發酵、腐解，產生大量的有益微生物如放線菌、霉菌和一些植物病害的拮抗菌以及這些有益菌的代謝產物。堆肥直接施入土壤或制成堆肥浸提液施用，通過營養競爭、拮抗、重寄生與捕食、誘導植物抗病性等作用抑制植物土傳病害的發生。

針對黃瓜猝倒病的發生特點和病原物，馬艷等科研人員從堆肥中篩選出100多株對病原菌有拮抗作用的菌株，再經過反復試驗，優中選優挑選出一株綜合性狀優良的放線菌，將其標記為A630。據試驗，A630生長速度和產孢子速度快，易繁殖；在黃瓜根際可以很好地定殖，不但可以產生抗生物質，營養競爭能力也較強；抗菌譜廣，對黃瓜立枯病菌、油菜菌核病菌等病原菌都有較強的拮抗作用；室內實驗結果，對黃瓜猝倒病防效可達50％—60％。