無菌動物（Germ free animals）是指機體內外均無任何寄生物（微生物和寄生蟲）的動物。此種動物在自然界中并不存在，必須用人為的方法培育出來。其法：一般將臨產前的健康動物用麻醉藥品或頸椎臼法處死后，立即浸泡在37℃滅菌液中，送進無菌室（或無菌隔離器），按無菌手術進行剖腹，切除帶胎子宮（子宮內首先應無菌），將其浸入消毒液里并輸送到另一隔離器中，切開子宮取胎，經用滅菌紗布揩拭仔體并斷臍（電刀切斷）后，放隔離器內人工喂乳或用其它品系的無菌母鼠作保姆供養。象小鼠和大鼠等用人工喂乳非常麻煩，故采用保姆代養較為方便。而象豚鼠因在一定程度上能自力飲乳，故人工哺乳較容易。另外，象禽類、魚類、昆蟲類，因是在卵中無菌的前提下進行的，故用藥物將卵周圍滅菌后移入無菌隔離器內使其孵化即可，而且，這些動物一般在在出生后能自力采食，故較易育成。