一般地說(shuō)，基因占有哪個(gè)位置，其遺傳效應(yīng)不變。但少數(shù)也有因?yàn)榛蛩幍奈恢貌煌淖兤浔硇偷模朔Q為位置效應(yīng)（A．H．Sturtevant，1925）。位置效應(yīng)有兩類，一是穩(wěn)定型（S）；一是變動(dòng)型（V）（E．B．Lewis，1950）。所謂S型效應(yīng)，是指2個(gè)突變基因排列為順式（ab/ ）和反式（a / b）時(shí)表型不同。例如關(guān)于黃果蠅的星狀眼（star）和星體眼（asteroit），順式時(shí)（Sast/ ）黃果蠅復(fù)眼大小近于正常（稍小），與之相反，反式時(shí)（S / ast）眼睛便顯著變小。關(guān)于V型位置效應(yīng)，已知當(dāng)正常基因位于異染色質(zhì)附近時(shí)，有些細(xì)胞表現(xiàn)為正常性狀，另有些細(xì)胞表現(xiàn)為突變性狀。例如黃果蠅X染色體的w 基因經(jīng)過(guò)倒位占有靠近核仁形成區(qū)異染色質(zhì)的位置時(shí)，其復(fù)眼表現(xiàn)為嵌合性，既有正常的小眼，也有白眼小眼。如果該基因再倒位，回復(fù)到原有位置時(shí)，則復(fù)眼表現(xiàn)為穩(wěn)定的正常表現(xiàn)型。因此可知，其基因本身并沒(méi)有發(fā)生改變。