蛋白質的肽鍵水解。將蛋白質分解至最基本單位氨基酸的，稱為完全水解，將達不到上述程度的水解，稱為限量水解。可以用化學方法在酸或堿中加熱進行分解（如6N鹽酸，110℃，24小時），也可以用蛋白酶在溫和的條件下進行分解。用適當的蛋白酶進行限量分解是確定蛋白質的氨基酸排列順序所必要的方法。關于生物體內的蛋白質分解，可見“蛋白質代謝”。