指真菌、細菌、病毒、線蟲侵染水稻致病和非侵染性生理病害。世界上生長在水稻上的微生物約230余種。中國發生的侵染性病害中，已知真菌病約50種、細菌病4種、病毒病8種、線蟲病10種。其中稻瘟病廣泛分布于世界各稻區，也是中國稻區的重要病害；稻紋枯病各稻區普遍發生，以長江流域為害較大；稻白葉枯病主要分布于亞洲、大洋洲稻區，中國南方稻區發生已有70多年的歷史。

1.播種至分蘗期病害：主要有生理性爛秧，綿腐病、立枯病；

2.分蘗至出穗期病害：主要有稻瘟病、白葉枯病和紋枯病；

3.出穗至成熟期病害：主要有稻曲病。