冬季辣椒育苗期間，往往會突然受到寒流的襲擊，溫度驟然降低，秧苗容易受凍害。如果溫度是緩慢降低，則秧苗不易結冰受凍；如溫度雖然不是太低，但低溫持續時間很長，特別是低溫與陰雨相伴隨，秧苗也很容易發生凍害。秧苗受凍害的輕重，還與低溫過后氣溫回升的快慢有關。如果升溫和解凍太快，秧苗組織易脫水干枯，造成死苗。辣椒苗防凍措施有以下幾方面。
    改進育苗方法　利用人工控溫育苗方法，如電熱溫床和工廠化育苗等，是解決秧苗受凍問題的根本措施。
　　增強秧苗抗寒力　避免秧苗徒長，在寒流來臨前盡量揭去覆蓋物，讓苗多照光和接受鍛煉。在雨雪低溫期間，盡量利用天氣放晴間隙，揭掉草簾，讓辣椒苗能受到陽光照射。雨雪停后猛然轉晴時，中午前后在苗床上蓋幾塊草簾，避免秧苗失水萎蔫。床土濕度大，秧苗易受凍害，所以寒潮來臨前要控制苗床澆水，床土過濕的可撒一層干草木灰吸濕。
　　合理施肥　增施磷鉀肥，苗期使用抗寒劑。秧苗噴施0.5％～1％的紅糖或葡萄糖水，可增強抗寒力。在3～4葉期噴施2次（間隔7天）0.5％氯化鈣溶液，可增強抗寒性。
　　保溫防凍　寒潮期間嚴密覆蓋苗床。進行短時間通風換氣時，要防止冷風直接吹入床內傷苗。夜晚加蓋草簾。可將稻草枯葉撒在秧苗上，寒潮過后再清除。苗床上蓋的草簾應干燥。下雪天雪停后，及時將雪清除出育苗場地。