1) 溶劑必須“干凈”，在使用前需經過濾板除去顆粒雜質，必要時，在進樣口再加一塊濾板，以除去可能由泵帶來的顆粒

2) 必須控制吸附色譜中溶劑的含水量，過量水會使吸附劑活性降低，溶質保留值下降

3) 如需在一定的PH值下操作，須定期測定溶劑PH值，大氣中的CO2溶解在流動相內將引起PH的改變，特別是貯液瓶密閉不嚴時這種影響可能更大

4) 軟質或半軟質填料的容漲率隨溶劑的極性的變化而變化，使用新柱時應先用25-30倍柱體積的合適流動相平衡；更換流動相時，如果兩種流動相互不相溶，需采用過度溶劑使前一種流動相逐步溶解去除（例如，2.2.4—三甲基戊烷換成甲醇時，必須用乙酸乙酯或其他溶劑過渡，直到標準物保留值達到穩定狀態）

5) 為延長不易裝填、價格昂貴的高效柱壽命，可在進樣器和色譜柱之間安裝預柱（預柱應有足夠的雜質容量），對流動相和樣品中的顆粒和雜質進行最后的過濾；在填充和連接預柱時，不應有額外造成譜帶變寬、分離度下降的死體積；預柱與色譜柱的體積之比應保持為1：15至1：25，以減小譜帶變寬