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香菇、猴頭、木耳等生產實踐中應用二次套袋技術（即在菇筒出灶時加套一層薄膜袋，使袋內菇筒不直接接觸環境空氣）進行生產，有效地解決了菌筒生產過程中交叉感染的問題，使菌株成活率保持在９７％以上。現將該技術介紹如下：
外袋的準備：外袋宜選用周長大于內袋周長２厘米、長度比內袋長５厘米、厚度為０．２絲的低壓聚乙烯薄膜袋，一頭打結封口待用。
及時套袋：料筒經過高溫滅菌出灶時，邊取出邊用外袋套好，并擰緊袋口搬入培養室，將料筒溫度降至２５℃以下。注意：料筒出灶后要迅速裝入外袋，避免其與外界環境接觸時間過長而感染雜菌。
接種操作：接種時，在接種室或接種箱內解開外袋，向封閉一方推動，拉開４／５后進行接種，接種完后馬上套好外袋擰緊放置。
適時脫去外袋：在培養過程中注意培養室溫度，待菌筒菌絲發至８０％左右時脫去外層袋，按常規生產方法管理。
