種子繁育 中藥材用種子繁育最為普遍。種子繁育技術簡單，利于引種馴化和新品種培育。但是種子繁育的后代容易產生變異，開花結實較遲，尤其是木本中藥材用種子繁育所需年限很長。所以中藥材良種繁育，一是加速繁育新的優良品種，以便更換已在生產上應用的老品種；二是保持新品種的優良性狀，防止混雜和退化。如元胡的塊莖分母元胡和子元胡，生產上必須用子元胡作種才能優質高產。又如貝母，因繁育系數很低，為保證種子的質量，生產上常將商品貝母生產地和種子繁育地分開。

    營養繁育 營養繁育在中藥材栽培中約占35%,如分根、分株或用鱗莖、塊莖、珠芽等繁育。有些中藥材收種子非常困難或不結種子，如黃連、川芎等，生產上一直采用營養繁育。中藥材用營養繁育比用種子繁育生長快，產量高，生長年限短，并能保持母本優良性狀，故多采用。如貝母用鱗莖繁育1年即可收獲，種子繁育需5年才能收獲。但有時長期營養繁育易引起品種退化，如地黃、山藥等，須注意隨時去雜、去劣，適時倒栽，防止退化。天麻長期營養繁育，品種退化嚴重，用天麻種子繁育 （樹葉菌床法）,長勢增強，既解決了品種退化問題，又解決了種源缺乏問題，產量和質量并增。

    組織培養 中藥材的組織培養就是把分離出來的中藥材組織（根、莖、葉的段、片、塊等）放入含有一種合成培養基的瓶中，于無菌操作條件下使之生長或發育。它利用中藥材體細胞的再生能力，培育出保持原品種固有性狀和特性的植株，是現代先進的中藥材快速繁育技術。在中藥材GAP（中藥材生產質量管理規范）種植中，常用組織培養的方法進行無病毒植株育種和生產無公害的綠色中藥材。如地黃農家品種金狀元，經過莖尖培養所得無病毒苗與原品種相比，病害輕，產量高，可使因感染病毒而退化的品種復壯。故應用生物技術進行中藥材優良品種的培育（包括多倍體育種和其他育種技術）和克隆化快速繁育，然后按國家GAP要求建立大面積生產基地，是從根本上解決我國中藥材質量問題的有效途徑之一。