山茶花在開花期間發生此病時，綻開的花瓣上有數量不一、形狀各異的褐色小斑點，有時甚至匯集成大斑塊。發病嚴重時，整個花朵都變成暗褐色，并且脫落。如果褐斑從花瓣基部出現，便導致花朵中心部分干枯。此病又叫花腐病。一般秋季發病率低，而12月到翌年3月，隨著氣溫升高，花朵受害率增高。山茶花花枯病的病原，是核盤孢屬的兩種真菌。病菌以堅硬的菌核在土壤和病殘植物體上越冬，并可以存活兩年以上。每年早春，菌核萌發，產生子囊孢子，并通過氣流傳播到花器上危害植株。低溫（10～18℃）及雨量充沛時，最易發病。該病原菌還可通過切花及苗木運輸遠距離傳播。

防治措施：①要加強山茶花苗木檢疫，避免病菌遠距離傳播。②要及時摘除凋萎的病花。③要在山茶花植株根部覆蓋一層五氯硝基苯的藥土或木屑，作為屏障。藥土的配制方法是：用40%五氯硝基苯（土壤散）粉劑，按1：100的比例，與新土配合。④用藥劑防治，即噴灑50%福美雙可濕性粉劑500～800倍液，防止病菌侵染。

山茶花除易患花枯病外，還常患枯枝病。由病原真菌浸染山茶花植株嫩枝，引起枝梢干枯死亡。對枯枝病可采取以下防治方法：冬修時剪去病枝燒毀；在新梢萌芽前，用甲基托布津、福美霜、百菌清等殺菌劑噴施，特別是在枝條傷口部位更要多噴藥；多施磷、鉀肥，以增強山茶花植株抗病能力等。