甲基化研究對于基因的調控和腫瘤的發生有非常密切的關系。在一般正常的細胞中，基因調控區CpG島處于非甲基化的狀態。而當細胞發生癌變后，這些CG區域往往呈現甲基化狀態。英國醫學刊物《Lancet》報道奧地利因斯布魯克醫學院的專家們早就可以通過檢測大便中DNA的甲基化變化，把健康人的大便與結腸癌患者的大便區分開。大便標本中SFRP2 甲基化的程度是診斷結腸癌最靈敏的標記。研究人員發現，腫瘤的發生以及一些遺傳病的出現和基因甲基化有非常密切的關系。目前DNA甲基化研究是腫瘤分子生物學研究的一個重要領域。

Pyrosequencing技術作為一種新的序列分析技術，能夠快速地檢測甲基化的頻率，對樣品中的甲基化位點進行定性及定量檢測，為甲基化研究提供了新的途徑。Pyrosequencing是一種通過合成方法進行序列分析的方法，它通過核苷酸和模板結合后釋放的焦磷酸引發酶級聯反應，促使熒光素發光并進行檢測。這項技術曾經被用作單核苷酸多態性（SNP）的基因型和單倍型的檢測，以及細菌和病毒的鑒定和分型研究。這項技術的一個主要特點是在Pyrogarm™軟件上顯示的峰值高度來自于序列分析的原始數據，通過峰值的高度可以精確的檢測混合DNA模板中等位基因的頻率。

Pyrosequcing系統可以獲得以下結果：
1 那些DNA序列位點發生甲基化？
2 每個位點的甲基化程度是多少？
3 這些位點的甲基化和疾病的相關性？