棉花嚴重缺硼時，頂芽萎縮，芽腋叢生形成多頭棉，或是頂部心葉變小，葉的邊緣和主脈失綠，葉片縐縮向上反卷，但無紅蜘蛛、薊馬等蟲害；下部老葉較大、肥厚、色深、易脆，葉脈突出，嚴重時木栓化壞死，葉柄出現明暗相間的環帶，在顏色較深的環帶處的組織發生膨脹，向外突出，使整個葉柄呈節狀，不平滑。剖視可見與環帶相應髓部變白，嚴重時變褐壞死，好似有蟲咬食，不久則脫落，花小而少，花冠縮短不易伸出，并向中心包裹不張開，花粉生活力差，幼鈴發育遲緩，往往較尖，也易脫落，果節數少而短。

防治棉花缺硼癥的有效辦法是補充硼素：（1）用0.1％硼砂或硼酸浸種12小時，然后進行播種。（2）苗期至花期用0.1～0.2％硼液噴施2～3次。過多的鉀會加重缺硼，因此使用鉀肥的田塊更應配合施硼。